Cette matière permet d’approfondir les connaissances en microbiologie fondamentale et moléculaire sur les bactéries, avec l’étude de leurs génomes,  de leur physiologie et  physiopathologie engendrée lors des interactions avec l’hôte, d’établir le lien entre le fonctionnement des bactéries au niveau moléculaire et le type de relation que ces micro-organismes entretiennent  avec leur hôte l'homme en particulier. Aborder les mécanismes de l'évolution (mutation, sélection, recombinaison), et comprendre les bases des techniques utiles pour la détection bactérienne.