l'objectif de ce cours est d'apprendre les notions de base de la programmation informatique et son application pour le traitement des données biologiques.

On apprend à utiliser Bioinformatics Toolbox de MATLAB pour l'analyse des séquences biologiques comme:
  1. l'alignement des séquences
  2. visualisation
  3. création et analyse des arbres phylogénétiques
  4. ...

Dans ce cours, l'étudiant apprend comment faire la comparaison entre deux séquences.

1- Comparaison visuelle en utilisant la matrice de points (DotPlot)

2- L'alignement de deux séquences

   a- Alignement Global (Needlman & Wansh)

   b- Alignement local (Smith & waterman)